Markmið sjóðsins, Vísindasjóðs Félags framhaldsskólakennara (FF) og Félags stjórnenda í framhaldsskólum (FS), er að auka tækifæri félagsmanna til framhalds- og endurmenntunar. Vísindasjóðurinn skiptist í tvær deildir, A-deild og B-deild.